数据出版的实践模式对比研究——以地球科学领域为例
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韩露,副研究馆员,博士。 |
收稿日期: 2019-03-04
网络出版日期: 2025-04-28
基金资助
中国地质科学院基本科研业务项目“深部探测知识库的建设与研究”(JB1602)
A Contrastive Study of Practical Modes of Data Publishing——Take the Field of Earth Science as an Example
Received date: 2019-03-04
Online published: 2025-04-28
[目的/意义] 科学数据出版是数据密集型科学发现的主要学术传播方式,对于实现数据重用、科学验证具有重要的意义。[方法/过程] 地球科学从原有的数据共享模式到目前的数据出版发生了巨大的变化。作者将数据出版分为数据期刊出版、数据仓储出版、数据和论文联合出版3种模式,对于每一种模式的实践方法和关键要素进行统计和对比,重点分析三种模式的优劣、同行数据评议问题和地学数据出版中分层元数据的重要性。[结果/结论] 通过研究,作者提出基于仓储的出版便于融入科学数据管理过程,有利于数据重用,但是此类出版方式缺少同行评议;数据的同行评议应该有别于学术论文,注重数据在参与科研和产生再生性成果的过程中的重用性;元数据的分层描述对于地学大数据的保存和重用都具有重要意义。
韩露 , 丁毅 . 数据出版的实践模式对比研究——以地球科学领域为例[J]. 知识管理论坛, 2019 , 4(3) : 152 -162 . DOI: 10.13266/j.issn.2095-5472.2019.016
[Purpose/significance] Scientific data publishing is the main mode of academic communication for data-intensive scientific discovery, which is of great significance for data reuse and scientific verification. [Method/process] Earth sciences has undergone a great change from the data sharing model to the current data publishing. Current practices of data publishing can be divided into three modes: data journal publishing, data warehousing publishing, data and paper joint publishing. The author made statistics and comparison on the practice methods and key elements of each mode, and emphatically analyzed the advantages and disadvantages of the three modes, peer data review issues and the importance of hierarchical metadata in geoscience data publishing. [Result/conclusion] Through research, the author proposes that warehouse-based publishing facilitates integration into scientific data management process and facilitates data reuse. However, such publishing mode usually lacks peer review. Peer review of data should be different from academic papers and should focus on the reusability of data in the process of participating in scientific research and producing regenerative results. The hierarchical description of metadata is of great significance to the preservation and reuse of geoscience big data.
Key words: data publication; data repository; data journal; geoscience data
表1 地球科学类数据期刊调查表 |
| 数据期刊 | GDJ | SD | ESSD | GCRDPR |
| 创刊年 | 2014 | 2014 | 2009 | 2014 |
| 出版者 | Wiley Online Library | Nature | Copernicus Pulications | 《全球变化数据学报(中英文)》编辑部 |
| 主题范围 | 地球科学领域的跨学科期刊 | 综合性期刊,包含地球科学与环境科学主题 | 地球科学领域的跨学科期刊 | 地理科学 |
| 期刊类型 | 专业型 | 综合型 | 专业型 | 专业型 |
| 同行评议流程 | 期刊内部的同行评议流程 | 期刊内部的同行评议流程 | 网络开放的两段式同行评议方法 | 内部专家匿名评议 |
| JCR影响因子(2016) | 2.800 | 4.836 | 6.696 | 无 |
| 数据集的访问方法 | 提交到建议的仓储中 | 提交到建议的数据仓储中 | 提交到建议的仓储中 | 期刊系统提供的数据仓储 |
| 数据集引用标准 | DataCite | 自定义标准 | DataCite | 自定义标准 |
| 出版方式 | 在线 | 在线 | 在线和纸行 | 在线 |
表2 4类期刊对数据集描述要求的对比 |
| 期刊名称 | GDJ | SD | ESSD | GCRDPR |
| 数据集可获取性标识(DOI或URI) | √ | √ | √ | √ |
| 数据集的覆盖范围 | √ | √ | ||
| 数据集格式信息 | √ | √ | √ | |
| 数据集授权许可信息 | √ | |||
| 项目信息 | √ | |||
| 数据重用信息 | √ | √ | √ | |
| 数据质量描述信息 | √ | |||
| 数据来源信息 | √ | √ | √ | |
| 对于数据引用的支持与规范 | √ | √ | √ | √ |
表3 三类仓储的数据出版和管理过程对比 |
| 仓储类别 | 公共数据出版平台 | 国际数据共享组织或数据中心(WDS) | 国家级地学研究机构的数据汇交共享平台 |
| 名称 | Pangaea | NISDC冰雪数据中心 | 英国国家地学数据中心 |
| 国家 | 德国 | 美国 | 英国 |
| 主题 | 以地学为主的综合性学科数据 | 冰川冻土研究数据 | 地质、地球物理、地球化学数据 |
| 数据来源 | ①世界各国科研人员提交的数据; ②地学科研项目的数据汇交 | ①NASA和NOAA所监测或采集的数据; ②美国自然科学基金(NSF)资助项目的数据; ③其他与冻土研究相关的科研数据 | 英国自然环境委员会资助的项目所产生的各类数据 |
| 数据提交 | ①采用Pangaea ticket system 提交数据; ②由作者将数据编辑成数据表进行提交; ③由数据管理员根据数据参数定义进行检查保存到相应的数据库中 | ①根据资助方提供不同的提交入口,利用网页和FTP服务提交数据; ②提交初步数据描述信息后,由数据编辑进行审核判断是否出版; ③同意出版后要求提交详细的数据文档和元数据,并通过FTP服务上传数据 | ①采用英国国家地球科学数据中心提供的统一数据采集入口; ②根据项目规定,按照元数据规范编辑元数据并提交数据集; ③经数据管理员审核后为提交的数据提供DOI注册服务 |
| PID注册标准 | DOI | DOI | DOI |
| 长期保存格式 | 数据表首选格式是制表符分隔文本文件(ASCII),或Excel格式,其他格式的文件要求以ZIP格式提交 | 支持各类数据格式 | 对专业数据格式进行了规范,其中岩土和环境数据为*.ags格式,地球物理数据为*.las、*.sgy、*.xtf格式 |
| 数据质量控制 | 数据参数的检查 元数据检查 数据的完整性和一致性检查 | 元数据检查 数据描述文档 数据集检查(由项目的内部专家进行数据的评议) | 数据格式 数据集检查 元数据检查 |
| 元数据标准 | Pangaea自定义的元数据 | 采用NASA的DIF标准[18] | 参照ISO19115地理信息元数据的标准自定义的元数据标准 |
| 数据引用规范 | 参照DataCite的标准提供数据的引用 | 自定义数据引用规范 | 自定义数据引用规范 |
| 开放获取程度 | 开放 | 部分开放,部分限制 | 根据项目的要求进行不同级别的开放 |
| 数据发现工具 | 具有推荐功能的统一数据发现工具;高级查询下载工具PANGAEA Data Warehouse | 统一数据发现工具;集成了NASA Earthdata和IceBridge的数据检索入口 | 统一数据发现工具 |
| 数据互操作服务 | SOAPREST | FTP | WMS、WFS、INSPIRE Service |
韩 露:论文相关的数据采集,数据出版关键问题的研究与论文撰写;
丁 毅:数据仓储研究和数据出版流程实践。
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